Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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SPIDRQ14159 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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SPIDRQ14159 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPIDRQ14159 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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