Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFR3AQ14156 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms