Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FAM53BQ14153 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM53BQ14153 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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