Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COL4A6Q14031 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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COL4A6Q14031 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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COL4A6Q14031 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COL4A6Q14031 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
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