Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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EXOSC2Q13868 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
EXOSC2Q13868 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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