Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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