Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C1orf61Q13536 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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