Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SKP2Q13309 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKP2Q13309 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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