Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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