Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms