Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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