Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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