Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TROQ12816 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TROQ12816 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TROQ12816 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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