Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SCRN3Q0VDG4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms