Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
SYCNQ0VAF6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SYCNQ0VAF6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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