Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms