Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNB2Q08289 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms