Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms