Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PAX8Q06710 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms