Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms