Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms