Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RNASELQ05823 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms