Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP7AQ04656 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP7AQ04656 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms