Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms