Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ID3Q02535 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ID3Q02535 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ID3Q02535 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ID3Q02535 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ID3Q02535 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ID3Q02535 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ID3Q02535 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms