Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC6A3Q01959 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms