Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BNC1Q01954 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms