Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POU5F1Q01860 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms