Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms