Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms