Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMF1P82094 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMF1P82094 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms