Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK2BP67870 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms