Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPS4XP62701 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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