Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERVK_113P62684 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms