Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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