Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DCAF7P61962 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms