Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3AP57075 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3AP57075 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3AP57075 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3AP57075 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3AP57075 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3AP57075 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms