Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIM2P55344 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIM2P55344 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIM2P55344 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIM2P55344 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms