Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3M2P53677 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AP3M2P53677 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms