Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E1P51965 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms