Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPC3P51654 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPC3P51654 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms