Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BRCA2P51587 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms