Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ERFP50548 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERFP50548 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERFP50548 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERFP50548 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms