Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTBP49356 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTBP49356 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms