Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GPR4P46093 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GPR4P46093 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPR4P46093 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms