Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP2P42575 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP2P42575 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CASP2P42575 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms