Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
LTBRP36941 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LTBRP36941 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms