Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM23P36406 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRIM23P36406 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms