Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ZNF83-219ENST00000602232 575 ntTSL 49.27□□□□□ -0.932e-11■■□□□ 11.8
GTF2F1P35269 ZNF83-208ENST00000596440 561 ntTSL 48.52□□□□□ -1.052e-11■■□□□ 11.8
GTF2F1P35269 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.092e-11■■□□□ 11.8
GTF2F1P35269 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.584e-9■■□□□ 11.8
GTF2F1P35269 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 24.7□□□□□ -1.664e-9■■□□□ 11.8
GTF2F1P35269 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 535.59■■■■□ 3.297e-25■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.577e-25■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.924e-7■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.364e-7■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 CROCCP2-206ENST00000639594 2175 ntTSL 1 (best)21.84■■□□□ 1.098e-7■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 520.97■□□□□ 0.958e-7■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.72■□□□□ 0.758e-7■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 TERF2-205ENST00000566750 917 ntTSL 213.79□□□□□ -0.24e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 TERF2-212ENST00000569611 556 ntTSL 49.61□□□□□ -0.874e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 RANBP1-209ENST00000432879 744 ntTSL 315.3■□□□□ 0.044e-12■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 525.8■■□□□ 1.727e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 525.66■■□□□ 1.77e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.497e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.17e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 FAM193B-211ENST00000508298 479 ntTSL 520.99■□□□□ 0.957e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.937e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.927e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 220.71■□□□□ 0.917e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 PIGZ-203ENST00000413127 1947 ntTSL 219.82■□□□□ 0.767e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 FAM193B-210ENST00000507587 825 ntTSL 219.49■□□□□ 0.717e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.697e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.57e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.477e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 517.81■□□□□ 0.447e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 FAM193B-208ENST00000506955 4604 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.417e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.327e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 515.04■□□□□ -07e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.077e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-207ENST00000579053 1313 ntTSL 514.48□□□□□ -0.097e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 314.01□□□□□ -0.177e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 213.85□□□□□ -0.197e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 413.5□□□□□ -0.257e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.277e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 513.05□□□□□ -0.327e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.417e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 512.4□□□□□ -0.427e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 GMDS-210ENST00000533279 817 ntTSL 511.89□□□□□ -0.517e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.527e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 211.76□□□□□ -0.537e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-208ENST00000439029 566 ntTSL 411.64□□□□□ -0.557e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 ENOSF1-217ENST00000584259 6340 ntTSL 211.5□□□□□ -0.577e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 210.16□□□□□ -0.787e-8■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 SLC38A10-210ENST00000573058 1627 nt26.74■■□□□ 1.878e-9■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 GMDS-201ENST00000380805 1743 ntTSL 221.56■■□□□ 1.043e-6■■□□□ 11.7
GTF2F1P35269 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 57.13□□□□□ -1.274e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.643e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.523e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 HAUS8-207ENST00000598517 1055 ntTSL 517.05■□□□□ 0.323e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 HAUS8-203ENST00000593360 3176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 HAUS8-208ENST00000601564 826 ntTSL 310.11□□□□□ -0.793e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 PPP1R12A-203ENST00000450142 5721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 PPP1R12A-202ENST00000437004 4639 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 PPP1R12A-216ENST00000550510 631 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-6■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.421e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 312.05□□□□□ -0.481e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.241e-8■■□□□ 11.6
GTF2F1P35269 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)19.36■□□□□ 0.698e-11■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.298e-11■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.158e-11■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.658e-11■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-8■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.762e-8■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PLCG1-220ENST00000617873 583 ntTSL 313.82□□□□□ -0.22e-8■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 223.73■■□□□ 1.391e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PDE3B-205ENST00000534317 5521 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.011e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.911e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.751e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.731e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 ABHD14B-207ENST00000487005 1998 ntTSL 219.27■□□□□ 0.681e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 PCBP4-213ENST00000489595 539 ntTSL 413.46□□□□□ -0.251e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.421e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 MSMO1-204ENST00000505270 482 ntTSL 35.01□□□□□ -1.611e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 519.34■□□□□ 0.693e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.533e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-6■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.927e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.577e-7■■□□□ 11.5
GTF2F1P35269 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.222e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.583e-6■■□□□ 11.4
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 83.8 ms