Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTNNA1P35221 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms